Hello,<br><br>I'm working with evolutionary algorithms applied to protein-protein docking.<br>I'd like to calculate de RMSD between the native complex and the complex achieved with my docking model. For that I was trying to make the superposition of the complexes using the match function through the Chimera command line.<br>
I called the function as:<br><br><span style="font-family:courier new,monospace">match #0 #1</span><br><br>and got the following message:<br><br><span style="font-family:courier new,monospace">Atoms in each selection must be in the same model</span><br clear="all">
<br>I'd like to know what am I doing wrong, or if there is anyway other way to obtain the RMSD and the superposed complexes.<br>I'm using the complex code PDB 1CHO.<br><br>Thanks for any help,<br><br><br>-- <br>Helder Ken Shimo<br>
<br>BSc in Biomedical Informatics (University of São Paulo - Brazil)<br>MSc candidate in Bioinformatics (University of São Paulo - Brazil)<br><br>--<br>"When I get sad, I stop being sad and be awesome instead." (Neil Patrick Harris as Barney Stinson)<br>