<font color='black' size='2' face='Arial, Helvetica, sans-serif'><font color="black" size="2" face="Arial, Helvetica, sans-serif">

<div> Dear Chimera-user list,<br>
<br>
I believe, currently, Chimera can not <font><font color="black" size="2" face="Arial, Helvetica, sans-serif">visualize</font></font> docking spheres (http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/dock6_manual.htm#OrientingtheLigand) files directly, in order to do so, we need to create a pdb file of the spheres and then visualize them.  <br>
<br>
It would be vary helpful for DOCK users if we could visualizes spheres directly from the .sph files produced by sphgen (http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/dock6_manual.htm#Sphgen) or sphgen_cpp.  <font><font color="black" size="2" face="Arial, Helvetica, sans-serif"> Radius and color information could then also be displayed. <br>
<br>
This might be a helpful new feature to be included in a future release of Chimera.  <br>
</font></font>
</div>



<div> <br>
Thank you,<br>
<br>

</div>



<div style="clear:both">Trent E. Balius<br>

Graduate Student, Rizzo Group,<br>

Department of Applied Mathematics and Statistics,<br>

Stony Brook University.<br>

Office: Math Tower 3-129, Phone: (631) 632-8519<br>

<font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">URL: 
http://www.ams.sunysb.edu/~tbalius/</font></font><br>

</div>

</font></font>