<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Matthias,<br>
    <br>
      Regarding your question of whether XPLOR format is best for you. 
    The main drawbacks are that the files are large and slow to read
    because they are text instead of binary.  Your files are probably 2
    to 3 times larger (about 8 to 12 bytes per value versus 4 bytes in
    binary format) and maybe 10x slower to parse since the text numbers
    have to be converted to binary.  Most map formats are binary for
    these reasons.  But those formats can be harder to write out since
    the headers are often not well documented, or are complex.  So stick
    with XPLOR if the size and speed are ok.<br>
    <br>
        Tom<br>
    <br>
    <br>
    <blockquote
cite="mid:4C984FDE8800244E861744C3B5E36BAB0EACAB62@EXCHMBX01.fed.cclrc.ac.uk"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=ISO-8859-1">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 12 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
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        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
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span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
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        {size:612.0pt 792.0pt;
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<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal">Dear all,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">                having succeeded in writing
          an XPLOR data file and importing it into CHIMERA, I was
          expecting to see<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">a cube like volume. Instead, I’m only
          seeing a thin plane. Is this to be expected?<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">The header for the XPLOR file is as below:<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">       1<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">SXD2001reciprocal_space_volume<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     301       0     300     301      
          0     300     301       0     300<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">    30.10000    30.10000    30.10000   
          90.00000    90.00000    90.00000<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">ZYX<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">       0<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.57280     0.05125     0.25826    
          0.23192     0.47232     0.40565<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.28667     0.06406     0.13678    
          0.22750     0.22332     0.11380<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">    -0.02432     0.32358     0.22395    
          0.06303     0.22736     0.27504<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.30512     0.21062     0.26810
              0.15033     0.25180     0.39434<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.85280     0.25197     0.07160    
          0.22430     0.28253     0.11386<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.34160     0.32177    -0.03150    
          0.22739     0.47072    -0.00241<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">     0.26013     0.20844     0.20823    
          0.30089     0.40608     0.23863<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">   -0.13479     0.28377     0.08277    
          0.25996     0.23550     0.09638<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">How can I get the entire volume to display
          as a volume rather than a single plane?<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Is the XPLOR format not a good one to use
          for this purpose?<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Many thanks and best wishes,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Matthias<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">----------------------------------------------------------------------------------------------<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Matthias
            Gutmann                                          Instrument
            Scientist SXD<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Rutherford Appleton
            Laboratory              Phone: +44 (0)1235 44 6397<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">ISIS
            Facility                                                         
            Fax: +44 (0)1235 44 5200<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Chilton
            Didcot                                                   
            Office : R3, 1.28<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Oxfordshire OX11
            0QX                                   Email:
            <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Matthias.Gutmann@stfc.ac.uk">Matthias.Gutmann@stfc.ac.uk</a><o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">UNITED KINGDOM<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
      </div>
      <br>
      <p>-- <br>
        Scanned by iCritical.
      </p>
      <br>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
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<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>
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</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <br>
  </body>
</html>