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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Dear all,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">                I’m trying to write volumetric data in XPLOR format in order to import it into<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Chimera for displaying. The volumetric data set is a general volume data set, not necessarily<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">an electron density map. However, it keeps on failing as Chimera keeps on thinking there<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">are only 262 data values, whilst expecting 90601 numbers (which is the correct number).<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I’m trying to write the XPLOR file in the format given on the CNS web page:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Format of CNS maps<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">The grid size of the map is determined by the GRID parameter in the FFT statement.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">The following lines show the beginning of a typical electron density map file:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">       2 !NTITLE <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> REMARKS FILENAME=""                                                                                                                         
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> REMARKS DATE:18-Jun-98  12:24:08       created by user:                                                                           
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">     30       4      12      15       5      10      16       2      12
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">0.40960E+02 0.18650E+02 0.22520E+02 0.90000E+02 0.90770E+02 0.90000E+02
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ZYX <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">      0 <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">-0.97086E+00-0.49927E+00-0.82774E+00-0.13491E+01-0.57034E+00-0.71253E-01
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">-0.19491E+00 0.61017E+00 0.10064E+01-0.22888E+01-0.94020E+00 0.77451E+00
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> 0.57539E+00-0.31211E-01-0.27430E+00-0.36526E+00 0.34772E+00 0.81884E+00
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">-0.19954E+01-0.10117E+01 0.18038E+01 0.19008E+01 0.11886E+00-0.41646E+00
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> 0.47560E-01 0.48855E+00 0.57606E+00-0.22320E+00-0.12787E+01 0.47590E+00<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">....<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">   -9999<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">  0.2044E-09  0.9999E+00<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Is this correct or is Chimera expecting a different format?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Looking forward to your replies!<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Many thanks and best wishes,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Matthias<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">----------------------------------------------------------------------------------------------<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Matthias Gutmann                                          Instrument Scientist SXD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Rutherford Appleton Laboratory              Phone: +44 (0)1235 44 6397<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">ISIS Facility                                                          Fax: +44 (0)1235 44 5200<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Chilton Didcot                                                    Office : R3, 1.28<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">Oxfordshire OX11 0QX                                   Email: Matthias.Gutmann@stfc.ac.uk<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-GB">UNITED KINGDOM<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>

<br><p>-- 
<BR>Scanned by iCritical.
</p>
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