Yes Elaine, this helps.<br>Thank you<br><br>Roberto<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 22, 2011 at 12:23 PM, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hi Roberto,<br>
It isn't a built-in function currently, but you can open the attached BILD file in Chimera (just use File... Open) to show the axes: X red, Y yellow, Z blue.<br>
<br>
The BILD format is very simple. In fact, the file just contains the following plain text:<br>
<br>
.translate 0.0 0.0 0.0<br>
.scale 5<br>
.sphere 0 0 0 0.5<br>
.color 1 0 0<br>
.arrow 0 0 0 5 0 0<br>
.color 1 1 0<br>
.arrow 0 0 0 0 5 0<br>
.color 0 0 1<br>
.arrow 0 0 0 0 0 5<br>
<br>
You can edit the file if you want to change the offset (the .translate line) or the size (the .scale line). BILD format is described here: <<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/bild.html" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/bild.html</a>><br>

<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
On Apr 22, 2011, at 6:34 AM, Roberto Kopke Salinas wrote:<br>
<br>
> Dear All,<br>
> Is there a way to draw and visualize the three axes of the PDB reference frame in Chimera?<br>
> Thank you for your help,<br>
> Roberto<br>
<br>
</div></div><br><br>
<br>
<br>
<br></blockquote></div><br>