Thank you Dr. Meng! Downloading the protein from the PDB worked, so I&#39;ll do this from now on.<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Feb 25, 2011 at 1:22 PM, Elaine Meng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hi Alexander,<br>
I don&#39;t know how that error message occurs, maybe the others will have some idea.  It sounds like you wouldn&#39;t be able to fetch anything from the PDB.<br>
<br>
In Chimera, I can fetch that entry and others from the PDB without problem.  I also tried turning off my internet connection first to see what error message results, but it is a different message from what you reported.  You could try using Help... Report a Bug in the Chimera menu and describe how you got the message, and include your email address if you want feedback.<br>

<br>
To be able to go through the tutorial now, however, you could just go to the PDB web site,<br>
&lt;<a href="http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do" target="_blank">http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do</a>&gt;<br>
search for entry 1d86, download the PDB file (text) to your computer in some location where you will be able to find it in a file browser, then open the file as a local file from Chimera (use File... Open in the menu and browse to its location). Then proceed with the tutorial.<br>

<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
On Feb 24, 2011, at 5:10 PM, Alexander Spyros Maris wrote:<br>
<br>
&gt; Hi, I was attempting to start part of the tutorial by fetching &quot;1d86&quot; from the PDB on my windows PC when I got the error message &quot;No connection because the target refused.&quot; Do you know how I can fix this?<br>

&gt; Thanks!<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Alex Maris<br><br>