<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:14pt"><DIV></DIV>
<DIV>Dear Elaine C. Meng,</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Thanks very much for your reply! I have successfully solved the problem after I consult with the mailing list archive! Thanks!<BR> </DIV>All the best,<BR><BR>Qinghua 
<DIV><BR></DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt"><BR>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt"><FONT size=2 face=Tahoma>
<HR SIZE=1>
<B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">From:</SPAN></B> Elaine Meng <meng@cgl.ucsf.edu><BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">To:</SPAN></B> Qinghua Liao <fantasticqhl@yahoo.com><BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Cc:</SPAN></B> chimera-users@cgl.ucsf.edu<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Sent:</SPAN></B> Thu, September 30, 2010 1:49:41 AM<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Subject:</SPAN></B> Re: [Chimera-users] how to set the transparency of ribbon<BR></FONT><BR>
<META content=off http-equiv=x-dns-prefetch-control><BASE>
<DIV>Hi Qinghua,</DIV>
<DIV>Basically you need to make a transparent color, then use it to color the ribbon.</DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>Please see this previous post for details: 
<DIV><http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2006-December/001155.html></DIV>
<DIV><BR></DIV>
<DIV>Best,</DIV>
<DIV>Elaine<BR>
<DIV><SPAN style="WIDOWS: 2; TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; BORDER-COLLAPSE: separate; FONT: medium Helvetica; WHITE-SPACE: normal; ORPHANS: 2; LETTER-SPACING: normal; COLOR: rgb(0,0,0); WORD-SPACING: 0px" class=Apple-style-span>
<DIV>
<DIV>----------</DIV>
<DIV>Elaine C. Meng, Ph.D. </DIV>
<DIV>UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab</DIV>
<DIV>Department of Pharmaceutical Chemistry</DIV>
<DIV>University of California, San Francisco</DIV>
<DIV><BR></DIV></DIV></SPAN><BR class=Apple-interchange-newline></DIV><BR>
<DIV>
<DIV>On Sep 28, 2010, at 11:28 PM, Qinghua Liao wrote:</DIV><BR class=Apple-interchange-newline>
<BLOCKQUOTE type="cite">
<DIV>
<DIV style="MARGIN: 0px; FONT-FAMILY: times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV style="MARGIN: 0px"></DIV>
<DIV style="MARGIN: 0px">Dear chimera's users,</DIV>
<DIV style="MARGIN: 0px; FONT-FAMILY: times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV style="MARGIN: 0px; FONT-FAMILY: times, serif; FONT-SIZE: 12pt">
<DIV style="MARGIN: 0px; FONT-FAMILY: times, serif; COLOR: rgb(0,0,0); FONT-SIZE: 14pt">
<DIV style="MARGIN: 0px">Could someone tell me how to set the transparency of ribbon of a protein? Thanks very much </DIV>All the best,<BR>Qinghua 
<DIV style="MARGIN: 0px"></DIV></DIV></DIV></DIV></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></DIV>
<META content=on http-equiv=x-dns-prefetch-control></DIV></DIV></div><br>







      </body></html>