<div>Hi,</div>
<div> </div>
<div>After I superimpose two structures using MatchMaker, I would like to save the coordinates of #1 after being superimposed with #0. When I save the PDB with the new coordinates and open #0 and #1 PDBs again, they do not superimpose.</div>

<div>Can this be done? What is the best way to achieve this?</div>
<div> </div>
<div>(Elaine, I have a third fragment I want to bond to the previously bonded one and since the first-second has moved now, I want to do this so that they are on the same axis).</div>
<div> </div>
<div>Thanks,</div>
<div>Sujata</div>
<div><br><br><br> </div><br><br><br>