Thank you Elaine and Eric,<br><br>I am downloading the latest version. I have two rna duplexes. For each of them, i have calculated sasa values and i want to use this as my attribute ie sasa1.txt for duplex 1 and sasa2.txt for duplex2. Can i tell this catogorically to chimera. Im scared that chimera should nt interchange or apply same .txt to both molecules.<br>
<br>Bala<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 17, 2010 at 7:01 PM, Eric Pettersen <span dir="ltr"><<a href="mailto:pett@cgl.ucsf.edu">pett@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div style="">Hi Bala,<div><span style="white-space: pre-wrap;">  </span>This problem was fixed about 5 weeks ago, so if you get a current daily build it will work (though you will also have to make the changes that Elaine suggests in her email).</div>
<div><br></div><div>--Eric</div><div><br><div><div style="margin: 0px; font-size: 16px;"><font face="Helvetica" size="5">                        Eric Pettersen</font></div><div style="margin: 0px; font-size: 16px;"><font face="Helvetica" size="5">                        UCSF Computer Graphics Lab</font></div>
<div class="im"><div style="margin: 0px; font-size: 16px;"><font face="Helvetica" size="5">                        <a href="http://www.cgl.ucsf.edu" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu</a></font></div><div style="margin: 0px; font-size: 16px;">
<font face="Helvetica" size="5"><br></font></div></div><div><div></div><div class="h5"><div>On Sep 17, 2010, at 8:19 AM, Bala subramanian wrote:</div><br></div></div><blockquote type="cite"><div><div></div><div class="h5">
Friends,<br><br>I want to define solvent accessibility as the attribute to create a worm representation. I used the template file 'percentExposed.txt' in the following link to create an attribute file. The sample file i creased is attached (exp.txt)<br>
 <br><a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/defineattrib/percentExposed.txt" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/defineattrib/percentExposed.txt</a><br><br>when i give the command: deffattr exp.txt <br>
 I get the following error. How to resolve the problem.<br><br>Traceback (most recent call last):<br>  File "/usr/local/chimera_15/lib/python2.6/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>
     return apply(self.func, args)<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/Midas/midas_ui.py", line 260, in processCommand<br>    midas_text.makeCommand(text)<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/Midas/midas_text.py", line 66, in makeCommand<br>
     f(c, args)<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/AddAttr/ChimeraExtension.py", line 33, in cmdAddAttr<br>    specInfo=[("spec", "models", "molecules")])<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/Midas/midas_text.py", line 424, in doExtensionFunc<br>
     extFunc(*tuple(processedArgs), **kw)<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/AddAttr/__init__.py", line 77, in addAttributes<br>    return _addAttr(attrFile, models, log, raiseTool)<br>  File "/usr/local/chimera_15/share/AddAttr/__init__.py", line 239, in _addAttr<br>
     from ShowAttr import ShowAttrDialog, screenedAttrs<br>ImportError: cannot import name screenedAttrs<br>ImportError: cannot import name screenedAttrs<br><br>  File "/usr/local/chimera_15/share/AddAttr/__init__.py", line 239, in _addAttr<br>
     from ShowAttr import ShowAttrDialog, screenedAttrs<br><br><br> </div></div><span><exp.txt></span>_______________________________________________<br>Chimera-users mailing list<br><a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
<a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br></blockquote></div><br></div><br><div><span style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;"><div style="">
<span style="font-size: medium;"><br></span><br></div></span> </div><br></div></blockquote></div><br>