Dear Chimera users,<div><br></div><div>I am trying to make a morphing pdb with chimera without opening the interface using --nogui option. It works and calculates the interpolation and then it crashes. If i understood it correctly,  it is trying to open the MD Movie GUI. By default morph movie command calls the MD Movie interface.  Is it possible to make it work without opening the interface. </div>
<meta charset="utf-8"><div><br></div><div>I am trying to run the script with chimera using the following command</div><div><br></div><div><font class="Apple-style-span" face="arial, sans-serif"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: collapse; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px; ">chimera --nogui --script chi1.py</span></font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="arial, sans-serif"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: collapse; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><br></span></font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="arial, sans-serif"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: collapse; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;">and my script chi1.py is the following</span></font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="arial, sans-serif"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: collapse; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><br></span></font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="arial, sans-serif"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: collapse; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><div>from chimera import runCommand</div>
<div>runCommand('open starting.pdb')</div><div>runCommand('open end.pdb')</div><div>runCommand('morph start #0')</div><div>runCommand('morph interpolate #1')</div><div>runCommand('morph movie')</div>
<div>runCommand('stop')</div><div><br></div><div>Thank you very much for your inputs.</div><div><br></div><div>Cheers</div><div>Rajan</div><div><br></div></span></font></div>