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<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Tom and Elaine,<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Is there a simple way to manipulate part of a protein structure
in Chimera? What I would like to do is the following. Let’s say I have a molecular
compose 8 helixes. 7 of them fit in the cryo-EM map perfectly but one short helix
is off probably owing to conformational change.   I would like to move
the short helix into the density map manually. The difficult part is how to
make a smooth transition for loop regions at both ends of the helix. Would you please
give me some advice on this?  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Thanks!<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Haixin<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>--<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Haixin Sui, Ph.D.<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Wadsworth Center<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>NYS Dept. of Health<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Empire State Plaza<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>P.O. Box 509<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>Albany, NY 12201-0509<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>(518)474-4235 (office)<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";
color:#1F497D'>(518)473-0309 (lab)<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>

</div>

</body>

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