Dear colleague:<BR>    I have  a question about the "find hydrongen bond" in Chimera. The dumb relax constraints in Chimera are "0.04 nm" and "20 degree".<BR>   I don't understand the meaning of the parameter. 20 degree may means the angle bias the line,but I can't figure out what is the 0.04nm. <BR>The cutoff of the hydrogen is 0.4nm, and the angle is about 90 degree or some other parameters depending on the strength of the hydrogen bond.<BR>  If we set the constraint as 0.02nm or0.03nm , few hydrogen bonds are found. I don't know the criteria. Can you give me some advice so that I can follow your instruction?<BR>   Sincerly Yours<BR>   WU Xue