
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">


<HTML><HEAD>


<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">


<META content="MSHTML 6.00.6000.16640" name=GENERATOR><LINK 


href="BLOCKQUOTE{margin-Top: 0px; margin-Bottom: 0px; margin-Left: 2em}" 


rel=stylesheet></HEAD>


<BODY style="FONT-SIZE: 10pt; MARGIN: 10px; FONT-FAMILY: verdana">


<DIV><FONT face=Verdana size=2>Hi</FONT></DIV>


<DIV style="TEXT-INDENT: 2em">Recently I wanna add change to a series of 


molecules for DOCK6 which are stored in a single .mol2 file. It seems that the 


Chimera GUI can just add change for one molecules at one operation. I wonder how 


to add change to all of them?</DIV>


<DIV style="TEXT-INDENT: 2em">Alternatively I just suppose to use 'split' shell 


command to seperate these molecules to single files and then add change to them. 


Then the key point is whether Chimera can run in command-line mode so that I can 


achieve by writing a shell script?</DIV>


<DIV style="TEXT-INDENT: 2em">Thanks in advance</DIV>


<DIV style="TEXT-INDENT: 8em">Yang</DIV>


<DIV style="TEXT-INDENT: 8em"><A 


href="mailto:zhouyang@mail.shcnc.ac.cn">zhouyang@mail.shcnc.ac.cn</A></DIV>


<DIV><FONT face=Verdana size=2></FONT> </DIV>


<DIV align=left><FONT face=Verdana color=#c0c0c0 size=2>2008-11-03 


</FONT></DIV><FONT face=Verdana size=2>


<HR style="WIDTH: 122px; HEIGHT: 2px" align=left SIZE=2>


<DIV><FONT face=Verdana color=#c0c0c0 size=2><SPAN>


<DIV>


<DIV><FONT face=Verdana size=2></FONT>周阳 ZHOU Yang</DIV>


<DIV>Master Candidate<BR>Drug Discovery and Design Center<BR>Shanghai Institute 


of Meteria Medica<BR>China Academy of Sciences<BR>555 Zu Chong Zhi Road , Zhang 


Jiang Hi-Tech Park, Shanghai, China (Postcode: 201203)</DIV>


<DIV> </DIV>


<DIV>Mobile: 86-137-6430-7897<BR>MSN: <A 


href="mailto:zhouyang_pku@hotmail.com">zhouyang_pku@hotmail.com</A><BR> </DIV></DIV></SPAN></FONT></DIV></FONT></BODY></HTML>