
<HTML>

<HEAD>

<TITLE>Re: [Chimera-users] Chimera electrostatic potential</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'>An excellent question, one we have tried wrestling with along the way, so far unsuccessfully. John<BR>

<BR>

<BR>

On 9/7/07 3:07 AM, "Kate Hardie" <kate@flamerock.com> wrote:<BR>

<BR>

</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'>Hi,<BR>

<BR>

I've been unable to figure out how to colour the electrostatic surface of a protein red/white/blue. I'm assuming that you have to some how assign electrostatic potential before colouring but how is this done? I'm using a Mac and I've tried to use apbs with pymol but it will not recognise my pqr file generated on the pdb2pqr server or generate it itself. <BR>

<BR>

Thanks,<BR>

<BR>

Kate<BR>

<BR>

<HR ALIGN=CENTER SIZE="3" WIDTH="95%"></SPAN></FONT><SPAN STYLE='font-size:12.0px'><FONT FACE="Monaco, Courier New">_______________________________________________<BR>

Chimera-users mailing list<BR>

Chimera-users@cgl.ucsf.edu<BR>

<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users">http://www.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><BR>

</FONT></SPAN></BLOCKQUOTE><SPAN STYLE='font-size:12.0px'><FONT FACE="Monaco, Courier New"><BR>

<BR>

</FONT><FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial">-- <BR>

<BR>

</FONT></SPAN>

</BODY>

</HTML>