
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">

<HTML>

<HEAD>

<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">

<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7234.20">

<TITLE>discontinuous ribbon for nuc. structure</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<!-- Converted from text/plain format -->


<P><FONT SIZE=2>Hello,<BR>

<BR>

While i make the ribbon representation for an RNA duplex, sometimes ribbon is discontinuous in between, what could be the reason for it ?<BR>

I hve two conformation sof the same duplex taken at 1ns interval from MD trajectory.  For one conformation, ribbon is continuous but for the other there is a discontinuity at the middle.. I analysed the structure, it seems ok.<BR>

<BR>

thanks in advance,<BR>

Bala<BR>

<BR>

</FONT>

</P>


</BODY>

</HTML>