
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">

<HTML>

<HEAD>

<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">

<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7226.0">

<TITLE>plotting RMSD vs Residue number</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<!-- Converted from text/plain format -->


<P><FONT SIZE=2>Hi,<BR>

<BR>

I was wondering if there was a way to use chimera to calculate Root Mean Squared Deviations<BR>

for individual residues or backbone atoms. In order to produce a graph showing the relative<BR>

freedom of different areas of a protein.<BR>

<BR>

James Isherwood<BR>

<BR>

<BR>

</FONT>

</P>


</BODY>

</HTML>