<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    We also use cygwin on Windows to compile Amber tools.  Chimera 1.9
    is old, we're getting ready to release 1.11.  Currently we're using
    Amber tools 15.  If you go to <a
      href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/sourcecode.html"><a class="moz-txt-link-freetext" href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/sourcecode.html">https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/sourcecode.html</a></a>,
    and click on Chimera SVN repository, you can browse to what we're
    currently using.  The patches we use are in the *.patch files.  You
    can see in the GNUmakefile which parts we build and which parts are
    installed.  Feel free to clean up our patches and submit them to
    ambermd.org.  We should champion them ourselves, but our focus is on
    Chimera's replacement right now.<br>
    <br>
        HTH,<br>
    <br>
        Greg<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 06/21/2016 12:32 PM, Abhilash J
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAKwA5+vYSqPD9vntVhPU_AvinaEMJS=L+jsJrMvPLY-K5Z2t1A@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div dir="ltr">
        <div>
          <div>
            <div><br>
            </div>
            <div>Dear all!<br>
            </div>
            <div><br>
            </div>
                 I am interested in compiling Amber tools for windows. I
            tried compiling it from the source code from AMBER website.
            I was successful for linux and cygwin, But i could not get
            it to work for windows environment. Few days back i came
            across chimera. You were able to compile and run the Amber
            tools code on windows environment. I downloaded and compiled
            the Amber tools part from the foreign section of the source
            code. I was unable to get it running on my machine. Also the
            version was old. In fact i looked at  chimera 1.9, it is
            currently using amber tools 12.   <br>
          </div>
              I believe the compile might have to do something with
          cygwin environment and mingw cross platform build. I think
          there should be patches which help in this build. I am unaware
          of them.  I might be wrong too. <br>
              All my efforts till now have not yielded a working code on
          windows.Please let me know what all will be required to
          compile amber tools on windows, and how i can compile it.<br>
              I will be grateful if you could help me or point me to the
          right direction.<br>
        </div>
            Thanking you.<br>
        <div>
          <div>
            <div>
              <div>
                <div>
                  <div data-smartmail="gmail_signature">
                    <div dir="ltr">
                      <div>
                        <div>
                          <div>
                            <div><br>
                              <br>
                              Regards<br>
                              <br>
                              Abhilash Jayaraj<br>
                            </div>
                            Research Scholar<br>
                          </div>
                          SCFBio<br>
                        </div>
                        <div>Dept. of Chemistry<br>
                        </div>
                        IIT Delhi<br>
                      </div>
                      New Delhi<br>
                    </div>
                  </div>
                </div>
              </div>
            </div>
          </div>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Chimera-dev mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Chimera-dev@cgl.ucsf.edu">Chimera-dev@cgl.ucsf.edu</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-dev">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-dev</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>